Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem52bQ0VBF2 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem52bQ0VBF2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem52bQ0VBF2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem52bQ0VBF2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem52bQ0VBF2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem52bQ0VBF2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem52bQ0VBF2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem52bQ0VBF2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms