Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,673 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
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Lrriq1Q0P5X1 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Lrriq1Q0P5X1 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Lrriq1Q0P5X1 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Lrriq1Q0P5X1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Lrriq1Q0P5X1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
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Lrriq1Q0P5X1 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrriq1Q0P5X1 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Lrriq1Q0P5X1 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms