Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubxn2bQ0KL01 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms