Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms