Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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Sh3bp2Q06649 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Sh3bp2Q06649 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Sh3bp2Q06649 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Sh3bp2Q06649 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3bp2Q06649 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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