Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms