Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1sQ02789 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms