Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms