Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms