Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Yy1Q00899 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms