Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp1P97350 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pkp1P97350 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms