Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms