Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad50P70388 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad50P70388 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms