Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

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Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprvP70289 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprvP70289 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprvP70289 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprvP70289 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprvP70289 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprvP70289 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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PtprvP70289 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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PtprvP70289 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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PtprvP70289 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprvP70289 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprvP70289 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprvP70289 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms