Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbdsP70122 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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