Protein–RNA interactions for Protein: P62878

Rbx1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbx1P62878 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbx1P62878 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms