Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Usp46P62069 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Usp46P62069 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Usp46P62069 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Usp46P62069 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Usp46P62069 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Usp46P62069 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Usp46P62069 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Usp46P62069 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Usp46P62069 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Usp46P62069 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Usp46P62069 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Usp46P62069 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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Usp46P62069 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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