Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gp1bbP56400 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms