Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FmodP50608 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FmodP50608 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FmodP50608 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms