Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LmnaP48678 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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