Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VdrP48281 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VdrP48281 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VdrP48281 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
VdrP48281 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
VdrP48281 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
VdrP48281 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
VdrP48281 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VdrP48281 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VdrP48281 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VdrP48281 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VdrP48281 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VdrP48281 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VdrP48281 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
VdrP48281 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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VdrP48281 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VdrP48281 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VdrP48281 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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VdrP48281 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VdrP48281 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VdrP48281 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VdrP48281 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VdrP48281 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VdrP48281 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VdrP48281 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VdrP48281 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VdrP48281 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VdrP48281 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VdrP48281 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VdrP48281 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VdrP48281 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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