Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Nedd4P46935 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4P46935 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4P46935 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4P46935 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4P46935 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms