Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx1-2P42580 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms