Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms