Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VtnP29788 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VtnP29788 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VtnP29788 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
VtnP29788 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VtnP29788 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VtnP29788 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VtnP29788 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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VtnP29788 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VtnP29788 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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