Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxraP28700 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RxraP28700 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RxraP28700 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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