Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa2P28309 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms