Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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PdgfraP26618 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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PdgfraP26618 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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