Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms