Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VimP20152 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VimP20152 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VimP20152 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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