Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms