Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Vpreb1P13372 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms