Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prf1P10820 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prf1P10820 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prf1P10820 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prf1P10820 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prf1P10820 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prf1P10820 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prf1P10820 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prf1P10820 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms