Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P10404 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P10404 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P10404 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms