Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms