Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cops6O88545 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops6O88545 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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