Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FxnO35943 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FxnO35943 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FxnO35943 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FxnO35943 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FxnO35943 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
FxnO35943 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FxnO35943 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FxnO35943 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FxnO35943 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FxnO35943 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FxnO35943 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FxnO35943 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FxnO35943 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FxnO35943 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FxnO35943 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FxnO35943 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FxnO35943 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FxnO35943 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FxnO35943 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FxnO35943 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FxnO35943 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
FxnO35943 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FxnO35943 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
FxnO35943 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FxnO35943 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FxnO35943 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FxnO35943 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FxnO35943 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
FxnO35943 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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FxnO35943 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
FxnO35943 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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FxnO35943 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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