Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih2O35089 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms