Protein–RNA interactions for Protein: O09010

Lfng, Beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase lunatic fringe, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LfngO09010 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LfngO09010 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LfngO09010 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LfngO09010 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LfngO09010 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LfngO09010 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LfngO09010 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LfngO09010 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LfngO09010 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LfngO09010 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LfngO09010 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LfngO09010 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LfngO09010 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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