Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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MttpO08601 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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MttpO08601 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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MttpO08601 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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MttpO08601 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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MttpO08601 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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MttpO08601 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MttpO08601 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MttpO08601 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MttpO08601 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MttpO08601 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MttpO08601 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MttpO08601 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MttpO08601 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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MttpO08601 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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MttpO08601 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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MttpO08601 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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MttpO08601 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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MttpO08601 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MttpO08601 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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MttpO08601 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MttpO08601 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MttpO08601 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MttpO08601 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MttpO08601 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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MttpO08601 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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MttpO08601 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MttpO08601 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MttpO08601 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MttpO08601 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
MttpO08601 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MttpO08601 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MttpO08601 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MttpO08601 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MttpO08601 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
MttpO08601 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MttpO08601 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MttpO08601 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MttpO08601 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MttpO08601 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MttpO08601 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MttpO08601 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
MttpO08601 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MttpO08601 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MttpO08601 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MttpO08601 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MttpO08601 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MttpO08601 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms