Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm2056J3QQ02 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms