Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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BC024978J3QPC3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC024978J3QPC3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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