Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms