Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3336J3QMQ6 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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