Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms