Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm21863J3KMP8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm21863J3KMP8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21863J3KMP8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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