Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
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Gm28048F7BCN0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Gm28048F7BCN0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Gm28048F7BCN0 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Gm28048F7BCN0 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Gm28048F7BCN0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Gm28048F7BCN0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Gm28048F7BCN0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28048F7BCN0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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