Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc175E9PVB3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc175E9PVB3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms