Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
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Gm3543D3Z235 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm3543D3Z235 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm3543D3Z235 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm3543D3Z235 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm3543D3Z235 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm3543D3Z235 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm3543D3Z235 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm3543D3Z235 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm3543D3Z235 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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