Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Phf11bB4XVQ1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Phf11bB4XVQ1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Phf11bB4XVQ1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Phf11bB4XVQ1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Phf11bB4XVQ1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms